Özel dil kurslarında ve kolejlerde dil öğretimi için uygulanan kur sistemi Kur'an-ı Kerim dersinde de uygulanacak. Buna göre, öğrenci hangi sınıfta seçmeli Kur'anı Kerim dersi almak isterse önce seviye tespit sınavına girecek daha sonra seviyesine göre bir kurdan eğitim alabilecek. Yeni sistemle 5. sınıftan 12. sınıfa kadar bir çocuk Kur'an-ı Kerim dersi seçmek istiyorsa seçebilecek. Her yıl geldiği seviyeye göre Kur'an dersi alacak. Bir sonraki yıl, bir önceki yılda kaldığı yerden devam edebilecek. Ayrıca 7. 9. veya 10. sınıfta bir yıl veya iki yıl Kur'an dersi almak isteyen öğrenci için seviye tespit sınavı yapılacak. Sınav sonuçlarına göre öğrenciler başlangıç, basit, orta, üst gibi seviyelere göre oluşturulacak olan sınıflarda eğitim görecekler. Seviyesine uygun olarak kaldığı yerden kur sistemi ile dersini istediği dönemde alabilecek. Kur sistemini, Diyanet İşleri Başkanlığı da Kur'an kurslarında uygulamaya başlamıştı.